En Morelos existen corrientes fluviales de tipo intermitente en la Cuenca del Río Balsas; el río Amacuzac, tributario de la misma cuenca, se origina en las faldas del Nevado de Toluca y recoge el caudal de los ríos Calcáceo y Zempoala, en los límites con el Estado de México.
En cuanto a la altitud, el estado de Morelos tiene su mínima altura en el Valle de Cuernavaca con 1,500 MSNM (metros sobre el nivel del mar), y la altura máxima se encuentra en la Sierra Nevada del Popocatépetl con 5 mil 465 MSNM.